作为世界兽医协会的一个分会，世界马兽医协会（WEVA）成立于1985年5月。鲁道夫•E. 泽勒尔博士（主席）和维农•萨普（干事）是这个新成立的协会的创始官员。

在1987年加拿大蒙特利尔召开的第二十三届世界兽医大会上，WEVA召开了其首届科学会议。 罗伯特•杰克博士替换泽勒尔博士成为主席。之后的WEVA会议分别于1989年举办德国埃森（与世界知名的Equitana展会共同举办），1991年举办于巴西的里约热内卢（以第二十三届世界兽医大会-马兽医分会的形式同时举办）。

在1993年，WEVA的官员团队扩大，增加了两名副主席：保罗•索雷尔博士（法国）和彼得•蒂蒙尼（美国），总部位于瑞士的国际马术联盟首席兽医官埃里克斯•阿托克博士取代萨普博士，成为协会干事。在其八年干事任期当中，萨普博士为WEVA的发展做出了巨大的贡献。

在1993年，WEVA会议和日内瓦马内外科大会共同召开。其董事会进一步扩大，彼得•卡灵斯博士（瑞典），迪斯•立顿（爱尔兰），约翰•陵基尔（美国），皮埃尔•利克乌斯(比利时），曼努尔•罗杰克斯（西班牙），S.瓦尔玛（肯尼亚）和 Tesuo Senta（日本）相继加入。作为WVA项目的一个部分，1995年WEVA大会在日本横滨召开。彼得•蒂蒙尼博士取代罗伯特•杰克博士成为新任主席。1997年，SIDI在意大利帕多瓦举办了第六届WEVA大会。

接下来，WEVA离开了WVA的荫泽，称为独立的协会，并接受了AVEF（法国马兽医协会）的邀请，于1999年十月在法国巴黎举办了下一届大会。接下来，WEVA董事会引入了固定会籍期限制度（2x4年期）。沃维克•贝利博士（美国－主席）和比尔•琼斯（美国－干事/司库）成为了新的高级官员，并负责起草WEVA的第一章程，再次之前该章程一直依附于WVA的章程。

在索伦托大会后，WEVA在２００１年至２００３年之间举办了一些列中级会议。这些会议分别在莫斯科，基辅，萨尔多瓦和北京召开。

2003年，阿根廷马匹兽医协会（AAVE）在布宜诺斯埃利斯举办了第八届WEVA大会。这次大会出席人数众多，同时也带来了协会规章的进一步修正。在2003年到2005年期间，协会多次举办中级会议项目，其中包括了在印度和匈牙利举办的马学继续教育项目。

第九届WEVA大会于2006年在摩洛哥马拉喀什召开。新一任的高级官员包括理查德•科尔德博士（法国-主席），和盖里•诺伍德（美国-初级副主席）。 朱利叶•吉尔伯格（丹麦）和沃伍德•贝里（美国）被分别选举为新一任的的干事和司库。在2006年和2007年，WEVA中级项目的会址延伸到巴格达，哥伦比亚和智利。

2008年，第十届WEVA会议由俄罗斯马医协会于俄罗斯举办。

2009年，第十一届WEVA会议由巴西马医协会ABRAVEQ举办。

2011年十一月，印度马业协会(IAEP)举办了第十二届WEVA大会。

2013年十月，匈牙利马业协会（HAEP）举办了第十三届WEVA大会。

2015年十月，第十四届WEVA大会由墨西哥马业协会（AMMVEE)举办于墨西哥。